當假山的基礎工程結束和基石（即拉底）的定位、墊平安穩后，就開始假山山體的分層堆疊了。一般我們將假山分成基礎層、中層和頂層。基石（基礎層）以上到頂層以下的中間層是假山造型的主要部分，它所占的體量最大，結構復雜多變，并起著接下托上、自然過渡的作用，同時又是引人玩賞的主要部分，所以其一石一式都會對假山的整體造型起著決定性的作用。
中層疊石在結構上要求平穩連貫，交錯壓疊，凹凸有致，并適當留空，以做到虛實變化，符合假山的整體結構和收頂造型的要求。具體疊砌的要領應做到：
接石壓茬　即所疊砌的山石，上下銜接必須緊密壓實。除了有意識地大塊面閃進以外，應避免下層山石的上面閃露出一些破碎的石面，北方假山匠師們稱之為“避茬”，認為“閃茬露尾”會流露出人工的痕跡而失去自然氣氛，會表現出皴紋不順。但有時為了要產生虛實變化，有意識地留有茬口或隙縫，不過在上一層的疊壓過程中，必須正確地選擇三個以上的支點進行疊壓，然而再用剎片進行剎緊封茬，以形成山石的風化節理。
　
　
偏側錯安　即在疊置山石時，力求破除對稱形體，避免四方形、長方形、品字形或等腰三角形的出現，講究運用折、搭、轉、換的技巧手法。所謂的折，是指山形在局部塊體上的變化，由一個方位折向另一個方位上去；搭是指假山塊體的搭接，在按層狀結構的疊置中，必須有搭接處才會有過渡關系；轉即假山塊體在空間方位上的變化，由一個方向轉到另一個方向上去；換則是假山塊體由一種節理層狀，換為另一種形式，如水平的層狀節理換為豎向的層狀節理。所以只有偏安得致，才能使假山的山體錯綜成美。
仄立避“閘”　假山石的疊置可立、可臥，也可似蹲狀。但仄立的兩塊山石則不宜象閘門一樣，否則很難和一般疊置的山石相協調。不過這也并不是絕對的，在自然界就有仄立如閘的山石，如在作為余脈的臥石處理時，可少許運用，但必須處理得很巧妙。
等分平衡　當放置基石即拉底時，平衡問題尚不突出，但當疊砌到中層時，因重心升高，山石之間的平衡問題就表現出來了?！秷@冶》中所說的“等分平衡法”，就是處理假山平衡的要領。所謂的等分“等分平衡法”是指在掇山疊石時，應注意假山體量的平衡，以免畸輕畸重，發生傾斜。

崖壁的堆疊和起洞是假山中層的主要形式。在疊置崖壁時，如作懸挑，其挑石應逐步分層挑出，過渡要自然，并能滿足正、側、仰、俯等多視角觀賞的要求，上面壓石的重量應為挑石重量的一倍以上，以確保穩定，正如《園冶》所云：“如理懸巖，起腳宜小，漸理漸大，及高，使其后堅能懸。”這里的“后堅能懸”就是指作懸崖時因層層向外挑出，重心前移，因此必須要用數倍于前沉的重力來穩壓內側，把前移的重心再拉回到假山的重心線上來。
關于假山洞，《園冶》說：“理洞法，起腳如造屋，立幾柱著實，掇玲瓏如窗門透亮，及理上，見前理巖法，合湊收頂，加條石替之，斯千古不朽也。”說明古代假山山洞的一般結構都是梁柱式的。假山山洞的洞壁是山洞的支架，它由柱和墻兩部分組成，在平面上，柱是點，墻是線，而洞就是面。古代不少梁柱式的假山洞采用花崗巖條石為梁，或間有“鐵扁擔”加固，這種方法即便用石加以裝飾，但洞頂和洞壁之間還是很難融為一體，缺乏自然。另一種則采用“疊澀”的方法，用山石向山洞內側逐漸挑伸，至洞頂再用自然山石為梁壓蓋，這種方法也稱為“挑梁式”，其兩端的搭接部分，每端應在15厘米以上。還有一種就是清代乾嘉年間戈裕良所創造的券拱式的假山洞頂結構，錢泳在《履園叢話》中說：“近時有戈裕良者，常州人……。嘗論獅子林石洞皆界以條石，不算名手，余詰之曰：‘不用條石，易于傾頹奈何？’戈曰：‘只將大小石鉤帶聯絡，如造環橋法，可以千年不壞。要如真山一般，然而方稱能事。’余始服其言。”由于這種券拱式結構的承重是逐漸沿券成環拱擠壓傳遞，所以不會出現如梁柱式石梁的壓裂、壓斷的危險，而且能頂壁一氣，整體感強。同時可在其中心部位夾掛懸石，以產生鐘乳石垂掛的效果。其施工時，中間應搭建支撐架。
假山的收頂（也稱結頂）是假山最上層輪廓和峰石的布局，由于山頂是顯示山勢和神韻的主要部分，也是決定整座假山重心和造型的主要部分，所以至關重要，它被認為是整座假山的魂。收頂一般分為峰、巒和平頂三種類型，尖曰峰，圓曰巒，山頭平坦則曰頂?？傊枕斠莆丈襟w的總體效果，與假山的山勢、走向、體量、紋理等相協調，處理要有變化，收頭要完整。